Translating genetic associations for Type-2 diabetes to biological processes using chromatin maps

Claes Wadelius
Dept. Of Immunology, Genetics and Pathology, Rudbeck Laboratory, Uppsala University


Populärvetenskaplig sammanfattning

Diabetes typ 2, tidigare kallad åldersdiabetes, blir allt vanligare i Sverige och i resten av världen. En bidragande orsak är ärftlig belastning, vilken orsakas av många olika genvarianter som nu kartläggs i storskaliga internationella projekt. Trots denna kunskap vet man inte exakt vilken gen som har rubbad funktion men vi ska klarlägga det i aktuella projektet. Analyser kommer också att göras för att finna gener som ger höga blodfetter och som därför ger det metabolas syndromet. Vi och andra antar att styrningen av hur aktiv vissa gener är, har ändrats vilket leder till sjukdomen. Stora tekniska framsteg har gjort att vi nu kan kartlägga hur alla gener styrs i ett enda experiment. Gener styrs på olika sätt i olika vävnader så vi kommer att studera de viktigaste, nämligen de insulinproducerande betacellerna, lever, muskel och fett. Geners aktivitet styrs av områden som kan ligga direkt intill eller på stora avstånd från genen. Oavsett var de styrande signalerna är belägna kan vi finna dom genom att läsa epigenetiska signaler, som vi sedan jämför med genetiska varianter som ger risk för diabetes. Funktionen hos genreglerande områden som ger risk för diabetes kommer vi att undersöka med en rad metoder i provrör, celler och på sikt hos patienter.